A260/A230很低影响定量PCR结果吗？

Nanodrop测定结果中，A260/A230比值有一个标准的范围，这个范围因不同的实验室和仪器而异。

通常，对于纯DNA和纯RNA，A260/A230比值的标准范围分别在1.8-2.2和2.1-2.3之间。然而，也有实验室使用的仪器给出的范围是2.3-2.4。

虽然Thermo在文章中给出的最低可接受值为1.65，但如果比值偏低，并不一定意味着有问题。只有在比值偏低很多时，才需要考虑核酸提取过程中可能存在的污染物残留。

在核酸提取过程中，常见的污染物包括蛋白质、胍盐、苯酚、Trizol、EDTA和乙醇等。这些污染物对A260/A230比值的影响各不相同。

例如，蛋白质污染会导致A260/A280比值降低。而胍盐残留虽然会降低A260/A230比值，但对下游实验的影响通常可以忽略不计。苯酚主要影响A260/A280比值，而Trizol用于RNA抽提，对DNA的A260/A230比值影响较小。

在排除了其他因素后，我们需要考虑EDTA和乙醇的影响。EDTA可以螯合金属离子，抑制DNase和RNase对核酸的降解作用。而乙醇则用于沉淀DNA并溶解可能结合在DNA上的盐离子。

如果乙醇残留，可以在通风橱中稍微吹2分钟让乙醇挥发后再加buffer测定。如果反复测定比值仍然很低，那么可能是EDTA的影响。EDTA是酸性物质，残留可能会导致结果出现很大偏差。在这种情况下，测定的核酸浓度和纯度结果可能不太可信，如果进行后续的qPCR定量，结果也可能出现偏差。