16S、18S与ITS介绍

在原核生物中，根据沉降系数的不同，rRNA被分类为5S、16S和23S三种类型。以大肠杆菌为例，它们的核苷酸数量分别为约120nt、1542nt和2906nt。尽管5S rRNA的基因序列较短，便于分析，但其信息量不足，并不适用于系统分类研究。相对地，23S rRNA则因其核苷酸序列较长而分析难度增加。

而16S rRNA则介于两者之间，其基因序列长度适中，既包含保守区域，也包含变异区域，因此成为了理想的生物标志物。科研人员根据其序列的不同可变区将其划分为九个部分，即V1至V9。

转向真核生物，rRNA根据沉降系数被划分为5S、5.8S、18S和28S四种类型。以人类为例，它们的长度分别为121nt、156nt、1869nt和5070nt。类似于原核生物的5S和23S，真核生物的5S、5.8S和28S rRNA同样不适合用于系统分类研究。

18S rRNA则因其适中的序列长度和既包含保守又包含变异的特性，成为了有效的生物标志物。科研人员同样根据其序列的不同可变区将其分为八个部分，即V1至V8（不含V6）。

此外，内转录间隔区（ITS）是染色体上SSU rRNA与LSU rRNA之间的特定区域。在真核生物中，存在两种ITS：ITS1和ITS2。ITS1位于18S和5.8S rRNA之间，而ITS2则位于5.8S和28S rRNA之间。

ITS序列的进化速度相当快，因此展现了丰富的序列多态性。这一特性使得它在不同的分类层次上都能提供独特的分子标记，不仅有助于准确界定物种在种水平上的分类，还能有效地鉴定近缘物种之间的亲缘关系，从而成为真菌在种和亚种水平上分类鉴定的重要工具。