多肽合成,Apelin 12 FRET,(MCA-) RPRLSHKGPMP(Dap-Dnp) -amide

多肽合成,Apelin 12 FRET,(MCA-) RPRLSHKGPMP(Dap-Dnp) -amide-有驾

Apelin-12 FRET Substrate Peptide

基本性质

英文名称:Apelin-12 FRET Substrate; (7-Methoxycoumarin-4-yl)acetyl-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-ε-Ahx-Dnp-NH₂

(注:ε-Ahx 常指6-氨基己酸,作为连接臂;Dap 可能指代一种含淬灭剂的特殊氨基酸衍生物,在此上下文中常为 ε-Ahx-Dnp 结构)

单字母多肽序列核心:RPRLSHKGPMP

(完整结构:MCA-[RPRLSHKGPMP]-Lys(ε-Ahx-Dnp)-NH₂ 或类似变体)

中文名称:7-甲氧基香豆素-4-乙酰基-精氨酸-脯氨酸-精氨酸-亮氨酸-丝氨酸-组氨酸-赖氨酸-甘氨酸-脯氨酸-甲硫氨酸-脯氨酸-(6-氨基己酸-2,4-二硝基苯基)-酰胺

等电点:理论估算值约为 11.5。肽段核心(RPRLSHKGPMP)富含碱性氨基酸(3个精氨酸,1个组氨酸,1个赖氨酸),呈强碱性。修饰基团(MCA, Dnp)不影响其净电荷计算。

CAS号:此为定制的研究用荧光底物肽,无通用CAS登记号。

分子量:计算值约为 1900-2000 Da(取决于连接臂和淬灭基团的确切结构)。

其他特性:

结构设计:这是一个荧光共振能量转移底物。其N端连接MCA荧光基团,C端通过一个连接臂(如6-氨基己酸)连接Dnp淬灭基团。当两者在空间上接近时,Dnp能有效淬灭MCA的荧光。

作用原理:该序列是基于Apelin-12设计的。Apelin-12是内源性APJ受体的天然配体之一,其C端可被特定的蛋白酶(如血管紧张素转换酶2)切割。当此肽被目标蛋白酶在荧光基团与淬灭基团之间切割时,两者分离,MCA荧光恢复,荧光强度的增加与蛋白酶活性成正比。

应用领域

酶学与生物化学研究:作为高灵敏度、连续性的荧光底物,用于测定ACE2以及其他可能切割Apelin的蛋白酶(如脯氨酸内肽酶)的活性、动力学参数(Km, kcat)和抑制常数。

药物发现与筛选:用于高通量筛选靶向ACE2或相关Apelin降解酶的新型抑制剂,或用于评估现有药物(如某些降压药)对ACE2活性的影响。

细胞信号转导研究:用于监测活细胞或组织中Apelin的降解动力学,研究其在APJ受体信号下调中的作用。

临床生化分析:潜在用于开发检测血清或组织中ACE2活性的诊断方法,与心血管疾病、COVID-19等相关。

应用原理

其应用原理基于 “蛋白酶切割触发的荧光去淬灭”:

构建FRET对:MCA(供体,发射光~393 nm)与Dnp(受体/淬灭剂,吸收光谱与MCA发射光谱重叠)通过一个能被特定蛋白酶识别的肽链连接。

活性依赖的信号产生:在完整肽中,荧光被淬灭,本底极低。当目标蛋白酶在识别序列(Apelin-12序列内的特定位点,如Pro10-Met11或Met11-Pro12之间)切割肽链后,MCA与Dnp物理分离,FRET效应消失,导致MCA在393 nm处的荧光强度显著增加。荧光增加值与酶活性线性相关。

药物研发

研发定位:作为药物研发过程中关键的“分析工具”和“筛选探针”,而非治疗性分子。

核心价值:

靶点鉴定与验证:帮助确认和量化候选药物对目标蛋白酶(如ACE2)的抑制效力。

机制研究:研究Apelin代谢调控机制,为开发通过抑制Apelin降解来增强其心血管保护作用的药物(如ACE2抑制剂)提供研究工具。

高通量筛选:适用于自动化微孔板读数仪,是发现新型酶抑制剂的首选方法。

优势:灵敏度高、操作简便、可实时监测、适用于复杂生物样本。

作用机理

该分子本身是蛋白酶底物,其“作用”是被切割并产生荧光信号。

底物结合:目标蛋白酶(如ACE2)的活性中心特异性识别并结合该肽段上的酶切位点(基于Apelin-12的序列)。

肽键水解:蛋白酶催化切割特定的肽键。

荧光去淬灭:切割导致荧光基团与淬灭基团分离,空间距离超出FRET有效范围,MCA荧光恢复。

信号输出:通过荧光酶标仪或分光光度计实时监测393 nm处的荧光强度变化,即可精确量化蛋白酶的活性。

研究进展

工具开发成熟:基于Apelin序列的FRET底物已被开发并商业化,成为研究Apelin代谢和ACE2活性的标准工具。

在ACE2研究中的关键作用:在COVID-19大流行期间,ACE2作为SARS-CoV-2的功能性受体备受关注。此类底物被广泛用于筛选能调节ACE2活性的化合物,以及研究病毒蛋白对ACE2功能的影响。

在心血管代谢研究中的应用:用于研究在高血压、心力衰竭、动脉粥样硬化等病理状态下,ACE2活性的变化及其与Apelin信号衰减的关系。

优化方向:不断有研究尝试改进底物序列(如使用Apelin-13或-17的片段)、更换荧光/淬灭基团对(如FAM/Dabcyl),以获得更高的灵敏度、稳定性和特异性。

相关案例分析

其他肽类FRET底物:如用于检测Caspase-3活性的底物(DEVD序列),用于检测β-分泌酶活性的底物(基于淀粉样前体蛋白序列)。其设计逻辑与本底物完全相同,只是识别序列针对不同的蛋白酶。Apelin-12 FRET底物是这一通用技术在特定信号通路(Apelin/APJ)中的成功应用。

基于Apelin的放射性标记配体:如[¹²⁵I]-(Pyr¹)Apelin-13,用于受体结合实验。与FRET底物(用于检测蛋白酶活性)不同,放射性配体用于检测配体与受体的结合能力,两者从不同角度研究Apelin系统。

ACE2的荧光底物:除了基于Apelin的底物,还有基于血管紧张素II(Ang II)或缓激肽序列设计的ACE2 FRET底物。基于Apelin的底物因其生理相关性(Apelin是ACE2的天然底物之一)而具有独特价值,可用于更贴近生理的药物筛选和机制研究。

在COVID-19药物筛选中的应用:多项研究利用此类或类似底物,高通量筛选大型化合物库,以

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